Troms fylkeskommune har siden 2011 jobbet målrettet for å få på plass et styrings- og kvalitetssystem. Arbeidet har vært prosjektorganisert, men skal nå implementeres i den ordinære driften. Arbeidet videreføres av en kvalitetsikringsgruppe som skal sørge for videreutvikling og bruk av systemet og det elektroniske verktøyet. 

Målet er at fylkeskommunen skal levere bedre tjenester gjennom helhetlig virksomhetsstyring og risikoreduksjon og en styrket internkontroll. Systemet er beskrevet i en håndbok - Styrings- og kvalitetshåndboken. Håndboken beskriver hvordan systemet fungerer på systemnivå: ansvarsforhold, rapporteringsløyfer og inneholder verktøy for at fylkeskommunen skal kunne ha en god og betryggende kontroll med virksomheten. Herunder prosedyre for rapportering av avvik og metode for risiko- og vesentlighetsvurderinger.

For at fylkeskommunen enkelt skal kunne dokumentere gjennomførte prosesser brukes et elektronisk verktøy som heter styrings- og kvalitetssystemet. Verktøyet består av 5 moduler:

• EK-håndboka (dokumentstyring). I EK-håndboken finner man blant annet HMS-, personal- og øknomihåndbok 
• Avviksrapportering (web)
• Risiko- og vesentlighetsvurderinger (web)
• Revisjoner (web)
• Vernerunder (web)